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編制

護衛艦隊

護衛艦隊直轄部隊

海上訓練指導戦隊
第1海上補給隊
第1輸送隊
第1海上訓練支援隊

護衛戦隊

第1護衛戦隊(司令部:横須賀基地)
 第1護衛隊
 第5護衛隊 
第2護衛戦隊(司令部:佐世保基地)
 第2護衛隊
 第6護衛隊
第3護衛戦隊(司令部:舞鶴基地)
 第3護衛隊
 第7護衛隊
第4護衛戦隊(司令部:呉基地)
 第4護衛隊
 第8護衛隊

地方配備部隊

第11護衛隊(横須賀基地)
第12護衛隊(呉基地)
第13護衛隊(佐世保基地)
第14護衛隊(舞鶴基地)
第15護衛隊(大湊基地)

航空艦隊

第一航空戦隊(佐世保)
     第一基地航空団(鹿屋航空基地)
+...

第1航空隊(鹿屋航空基地)
隊本部
第11飛行隊・第12飛行隊:P-3C(コールサイン "JUPITER")
第1列線整備隊
第1整備補給隊(鹿屋航空基地)
隊本部
第1航空機整備隊
第1電子整備隊
第1武器整備隊
第11検査隊
第12検査隊
第1補給隊
鹿屋航空基地隊(鹿屋航空基地)
隊本部
鹿屋管理隊
鹿屋警衛隊
鹿屋運航隊
鹿屋経理隊
鹿屋厚生隊
鹿屋航空衛生隊
     第五基地航空団(那覇航空基地)
     第二二基地航空団(大村航空基地)
     第三一航空群(岩国航空基地)
     第一一一航空隊(岩国航空基地)
     第一航空修理隊(鹿屋航空基地)

第二航空戦隊(大湊)
     第二基地航空団(八戸航空基地)
     第二航空修理隊(八戸航空基地)
     機動施設隊(八戸航空基地

第三航空戦隊(横須賀)
     第4航空群(厚木航空基地)
     第21航空群(館山航空基地)
     第51航空隊(厚木航空基地):航空機等の試験評価および運用指導
     第61航空隊(厚木航空基地):YS-11、LC-90による輸送部隊
     航空管制隊(厚木航空基地)

航空教育集団
     教育航空集団司令部 - (下総航空基地)
     下総教育航空群 - (下総航空基地)
     徳島教育航空群 - (徳島航空基地)
     小月教育航空群 - (小月航空基地)
     第211教育航空隊 - (鹿屋航空基地)

潜水艦隊

潜水艦隊司令部(横須賀基地)
 第1潜水戦隊(呉基地)
 第2潜水戦隊(横須賀基地)
潜水艦教育訓練隊(呉基地)
 第1練習潜水隊(呉基地)
横須賀潜水艦教育訓練分遣隊(横須賀基地)